新疆少数民族民间剪纸的色彩运用相似。主要用白色、黑色及红色,巫术使用时会用其他颜色。维吾尔族、哈萨克族、柯尔克孜族、塔吉克族等的民间剪纸都是以植物为主,很少表现人物,色彩崇尚绿、黑、白三色。例如,维吾尔族民间剪纸多用于印染、刺绣、毡毯等生活用品上。
其服饰上崇尚的红色,和该民族早期信仰过萨满教、袄教、拜火教等多种宗教有关,把红色作为火的象征,代表着光明与希望,喜庆婚嫁的剪纸窗花“葵”受到汉族的影响也多用红色。一些游牧地区把剪纸染成黑色,用以崇拜,有的作为记事用,在属于突厥语族的维吾尔语、哈萨克语、柯尔克孜语中“喀喇”都与“黑色”有关,含有伟大、崇拜等意。高昌“国旗用黑色”,新疆传统的艾德来斯绸也用黑色,喜爱用黑色是一种民族的心理感受。而宗教剪纸中的缤纷色彩则是故弄悬虚,制造神秘气氛用的。